公司购进商品，在运输途中发生交通事故，商品大部分毁损，已收到保险公司赔款，损坏的商品进项税额是否需要转出？

不需要将进项税额转出。 《中华人民共和国增值税暂行条例》(2017年版)第十条规定，下列项目的进项税额不得从销项税额中抵扣：（一）用于简易计税方法计税项目、免征增值税项目、集体福利或者个人消费的购进货物、劳务、服务、无形资产和不动产；（二）非正常损失的购进货物，以及相关的劳务和交通运输服务；（三）非正常损失的在产品、产成品所耗用的购进货物（不包括固定资产）、劳务和交通运输服务；（四）国务院规定的其他项目。 《中华人民共和国增值税暂行条例实施细则（2011年版）》第二十四条规定，条例第十条第（二）项所称非正常损失，是指因管理不善造成被盗、丢失、霉烂变质的损失。 综上所述，公司因交通事故导致的商品损失不属于非正常损失，不需要作进项转出处理。