两处取得工资薪金按月代扣代缴的时候两个扣缴义务人都按照5000减除费用代扣代缴吗?

只能选择一处扣除。并且现在税务系统上线了提示功能，如果税务局通过系统扫描发现多处扣除5000元/月后，会通过短信提示要求纳税人去税务局更正申报。

另外如果存在两处及以上所得，由于两个及以上扣缴义务人是按各自金额独立申报，没有汇总收入，可能会造成多交或少交税款，此时建议纳税人年度终了后下一年度进入“个人所得税APP”中进行个人所得税汇算清缴，多退少补。