公司自然人股东减资，公司减资流程需要先税务后工商吗？

这个不一定，各地政策执行有差异。大部分地区直接到市场监督管理局办理工商减资手续即可；但也有部分地区将减资视同股权转让，先办理税务手续再办理工商手续。（具体办理程序需要联系主管机关进一步核实确认）

主要是因为公司的自然人股东减资属于《股权转让所得个人所得税管理办法（试行）》（国家税务总局公告2014年第67号）中的股权转让行为，同时《中华人民共和国个人所得税法》第十五条又规定个人转让股权办理变更登记的，市场主体登记机关应当查验与该股权交易相关的个人所得税的完税凭证。