自然人股权转让能在网上申请办理吗？

部分地区可以。目前国家税务总局将北京、安徽、江西、山东等四个省份纳入试点范围，积极推进纳税人网上办理股权转让自行申报事项。办税人通过自然人电子税务局线上发起股权转让申报申请并通过线上报送股权转让合同(协议)、资产价值评估报告、其他相关证明等资料 。随后经股权受让方登录自然人电子税务局确认相关信息后，主管税务机关管理人员审核后，即完成股权转让网上申报业务。