申请留抵退税是否影响附加税申报？

根据规定，对实行增值税期末留抵退税的纳税人，允许其从城市维护建设税、教育费附加和地方教育附加的计税（征）依据中扣除退还的增值税税额。

举例：假设 2022 年 5 月申请留抵退税 10 万，2022 年6 月需要申报缴纳 25 万的一般计税方法下办法产生的增值税，那么 2022 年6 月申报附加税的计税依据是按 25-10=15 万。6月份纳税申报时，在附表五（附加税费情况表）留抵退税本期扣除额填写10万。